Es catedrático emérito de Psicobiología en la Universidad Autónoma de Barcelona y miembro numerario de la Academia de Psicología de España. Ha realizado estudios y trabajos de investigación en las universidades del Ruhr (Alemania), de Oxford (Reino Unido) y en el Instituto Tecnológico de California (Caltech, EE. UU.).
Ha sido decano fundador de la Facultad de Psicología, director del Departamento de Psicobiología y de Metodología de las Ciencias de la Salud, director del Instituto de Neurociencias y director de Máster en Psicobiología y Neurociencia Cognitiva, todo ello en la Universidad Autónoma de Barcelona. Ha sido miembro de la Sociedad Española de Neurociencia (SENC) y del comité ejecutivo de la European Brain and Behaviour Society (EBBS).
Durante más de 40 años ha impartido clases de Psicología Fisiológica y formado parte del grupo de investigación de su universidad sobre Potenciación y recuperación de la memoria por estimulación eléctrica cerebral en ratas normales y con daño cerebral, del que ha sido investigador principal en la mayor parte de su historia.
Realizó el trabajo experimental de su tesis doctoral en la Universidad del Ruhr, Alemania, sobre autoestimulación eléctrica intracraneal en ratas, técnica que implantó y desarrolló en el laboratorio de psicobiología de la Universidad Autónoma de Barcelona del que fue pionero y propulsor, siendo uno de los primeros laboratorios españoles de su especialidad en incluir técnicas electrofisiológicas, fabricación e implantación de electrodos intracraneales, cirugía estereotáxica y análisis histológico cerebral post-morten, además de numerosas técnicas de evaluación conductual en ratas. Su principal objetivo experimental en ese laboratorio durante más de 40 años ha sido la facilitación del aprendizaje y la memoria por estimulación eléctrica de áreas cerebrales de la recompensa y el placer en ratas normales y con daño cerebral.
En su laboratorio se han formado decenas de investigadores nacionales e internacionales. Muchos de ellos, hombres y mujeres, hoy son profesores titulares o catedráticos de la especialidad de psicobiología en la propia Universidad Autónoma de Barcelona y en otras universidades españolas o hispanoamericanas.
Ignacio Morgado ha dirigido o codirigido una treintena de tesis doctorales y proyectos de fin de carrera. Es autor de un centenar de trabajos sobre psicobiología y neurociencia cognitiva, publicados en revistas y libros nacionales e internacionales. Tiene comunicaciones en forma de posters y orales en una treintena de congresos nacionales e internacionales. Ha sido autor del blog En las entrañas de la mente (en Investigación y Ciencia, la edición española de Scientific American) y tiene un espacio propio (Materia Gris) en el diario El País, donde, desde hace años publica regularmente artículos de divulgación actualizada en psicobiología y neurociencia cognitiva. Ha publicado también artículos científicos y de opinión en otros diarios españoles como, El Mundo y La Vanguardia, y en revistas culturales como Claves de la Razón Práctica o la Revista del Consejo Escolar del Estado.
Durante su periplo académico ha impartido conferencias y cursos de psicobiología y neurociencia en casi todos los países de Hispanoamérica (México, Costa Rica, Cuba, Puerto Rico, Colombia, Ecuador, Perú, Paraguay y Uruguay) y en Brasil, por lo que recientemente ha recibido la distinción de Miembro de Honor de la Red Iberoamericana de Neurociencia Cognitiva.
Premio Extraordinario de Licenciatura (1976), Premio de la Sociedad Española de Psicología (1982, tesis doctoral), Premio Divulga del Museo de la Ciencia de Barcelona (1985), Premio Científico Profesional del Colegio Oficial de Psicólogos de Andalucía Oriental (2001), Premio Atlas de artículos de divulgación sobre Neurociencias (2014), Premio Ramón Bayés de la Societat Catalano-balear de Psicología a la mejor trayectoria profesional (2016) y Colegiado de Honor del Col.legi Oficial de Psicologia de Cataluña (2019).
Ha realizado asesorías científicas para Editorial Ariel (Grupo Planeta) y CosmoCaixa de Barcelona.
Durante varios años ha tenido también una actividad relevante como Miembro de la Comisión Evaluadora de Ciencias Sociales y Jurídicas de la Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y la Acreditación (ANECA) del Ministerio de Educación y Ciencia y como miembro y presidente de la Comisión Nacional Evaluadora de la Actividad Investigadora (CNEAI).
Sus principales obras de divulgación científica, además de sus numerosos artículos en diarios nacionales, son Emociones e Inteligencia Social: Las claves para una alianza entre los sentimientos y la razón (Ariel, 2007), Cómo percibimos el mundo: una exploración de la mente y los sentidos (Ariel, 2012), Aprender, recordar y olvidar: claves cerebrales de la memoria y la educación (Ariel, 2014 y 2024), La fábrica de las ilusiones: Conocernos más para ser mejores (Ariel, 2015), Emociones corrosivas: Cómo afrontar la envidia, la codicia, la culpabilidad y la vergüenza, el odio y la vanidad (Ariel, 2017). Deseo y Placer: La ciencia de las motivaciones (Ariel, 2019). Materia Gris: La apasionante historia del conocimiento del cerebro (Ariel, 2021) y El cerebro y la mente humana: Cómo son y cómo funcionan (Ariel 2023).